หลังจากYumi’s Cells ภาคแรกจบลง เรื่องราวของ Yumi’s Cells 2 ดำเนินเรื่องต่อเนื่องทันที ยูมี รับบทโดยคิมโกอึน ได้จบความสัมพันธ์รักครั้งเก่าไป และเริ่มความสัมพันธ์ครั้งใหม่ กับ ยูบาบี รับบทโดย จินยอง แล้วความรักครั้งนี้ของยูมีจะสำเร็จหรือไม่?